Die Modellpflege setzte sich 1959 mit der MZ RT 125/3 fort. Die wichtigste Neuerung am Motor war wohl der Einsatz eines Viergang-Getriebes. Mit einem grösseren Vergaser erreichte der Motor jetzt 6,5 PS bei 5200 Umin^-1. Aber auch das Styling veränderte sich: der Lenker war jetzt verkleidet und es wurde ein grosser Werkzeugkasten montiert.

Das Bild zeigt die MZ RT 125/3 mit verkleidetem Lenker. Dies war der Endstand der RT-Entwicklung in Zschopau. Bis zur Einstellung der Produktion im Oktorber 1962 wurden mehr als 300.000 Motorräder des Typs RT verkauft.